北京九中的办学指导思想是“全人教育”， 全人教育，首先是人之为人的教育，其次是传授知识的教育，第三是和谐发展心智，以形成健全人格的教育。九中以“树立民主意识，建立和谐团队，倡导自主发展”为原则，努力实现各种资源的整合，尊重个性、尊重多元，培养整体发展、身心俱健的全人。
学校的育人目标是：关注健康、尊重个性、
培养勇于负责、善于学习的现代公民。
现代公民的培养，需要学校以丰富的课程来实现。
以社会责任感课程，培养有担当的现代公民
现代公民要适应数字化生存，要有高尚的信息道德、娴熟的信息理解与分析能力、积极的信息共享与交流合作能力、主动运用信息技术解决问题的意识与能力、数字化思考实现创造与创新的能力等。通过信息素养课程，培养“数字公民”，这是现代公民的核心特征。
在信息素养中,信息道德是至关重要的。信息道德包括信息道德的主观方面和信息道德的客观方面。前者指人类个体在信息活动中以心理活动形式表现出来的道德观念、情感、行为和品质，如对信息劳动的价值认同，对非法窃取他人信息成果的鄙视等，即个人信息道德；后者指社会信息活动中人与人之间的关系以及反映这种关系的行为准则与规范，如扬善抑恶、权利义务、契约精神等，即社会信息道德。
责任感课程还包括日常行为规范课程、生命教育课程、生涯规划课程等。我们认为，作为一个现代公民，必须对自己负责、对他人负责、对环境负责。通过这些课程的学习，增强学生的责任感，这一点与校训中的“砺志”、“博爱”是契合的。
我们期待北京九中的学生，都是有胆识、有担当的现代公民。
以持久学习力课程，培养有抱负的现代公民
现代公民的竞争力来自学习力，持久学习力的培养，是九中的特色，与九中校标中的“9”的含义之一——“久”是一致的。善于学习的现代公民，尤其要关注持久学习力的提升，这是未来持续竞争力的基础。
作为现代公民，要有领袖风范。、社团组织课程、创新人才培养课程等领导力课程的学习，学生成为自信、正直、进取、开放的创新人才，他们将成为各行各业的领导者，将成为未来世界的领导者，带领中华民族实现伟大复兴。
对中国传统文化的理解与尊重，是现代公民的内在气质。我们通过“国内游学”，加深学生对中华文化的了解；通过“京西古道文化”课程，促进学生对家乡、社区的热爱；通过“传统节日进校园”活动，增强民族文化的自豪感和责任感。
现代公民将是世界公民，他们与世界的距离是如此之近。他们要心怀祖国，放眼世界。既要尊重和理解国外的优秀文化，也要弘扬和传播中国的传统文化。我们通过“国际游学”课程，培养学生的国际视野，增进文化交流。
我们坚信北京九中的学生，都是有能力、有抱负的现代公民。
以健康与审美课程，培养有品位的现代公民
现代公民既要有强健的体魄，又要有强大的心理。要有每天锻炼一小时的习惯，也要有至少一项能伴随终身的体育特长。作为现代公民，要能适应学习、生活、交往中的各种压力，有积极向上的心态和自我调节心理的能力，同时要有努力为祖国健康工作五十年的情怀。
现代公民既要有高尚的审美情操，又要有健康的审美情趣。不仅要能理解美，欣赏美，还要能发现美，创造美。通过审美课程，实现科学求真求美，人文求善求美，艺术求新求美。同时发挥北京九中“金帆舞蹈团”、“艺术体操”等特长，尊重学生个性发展。
我们自豪北京九中的学生，都是有志趣、有品位的现代公民。
通过丰富的课程建设与实施，突出北京九中的特色，关注学生的身心健康，尊重学生的自主选择，真正培养勇于负责、善于学习的现代公民，实现“培养身心健康、人格健全、学有所长、和谐发展的全人”的宗旨。
